Skip to main content

Table 4 Analysis of amino acid mutations in epitopes domains of field strains and the CV777 attenuated vaccine strain (aa 498–637, aa 747–754 and aa 763–770 located in CV777 attenuated)

From: Detection and phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea virus in central China based on the ORF3 gene and the S1 gene

Strains

499

500

514

516

520

522

526

530

543

548

561

572

583

587

590

593

604

607

608

611

632

634

636

751

762

763

765

766

768

CV777 attenuated

T

L

S

A

H

G

I

T

R

T

S

K

K

S

L

G

E

S

G

F

Q

V

D

G

P

L

D

G

V

CV777

    

L

S

V

         

A

  

L

E

I

   

S

Y

  

CH/ZMDZY/11

   

S

R

 

T

  

S

  

N

  

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNHB-1

D

  

S

     

S

     

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNHB-2, CH/HNHB-5

  

A

S

     

S

     

S

D

 

S

 

E

    

S

S

  

CH/HNHB-3

 

P

 

S

     

S

     

S

    

E

    

S

S

D

 

CH/HNHB-4

A

  

S

     

S

 

N

   

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNHB-6, CH/HNHB-7

  

A

S

     

S

     

S

D

   

E

    

S

S

  

CH/HNKF-1, CH/HNLY

   

S

     

S

     

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNKF-2

   

S

     

S

Y

    

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNKF-3

   

S

     

S

Y

   

P

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNSMX

         

S

   

T

 

S

    

E

 

G

  

S

S

  

CH/SXYC

   

S

   

A

 

S

     

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNXC

   

S

     

S

     

S

    

V

    

S

S

  

CH/HNXX

   

S

     

S

     

S

  

V

 

E

    

S

S

  

CH/HNAY

A

  

S

Y

    

S

     

S

    

E

   

L

S

S

  

CH/HNNY-1, CH/HNNY-2, CH/HNNY-3,

   

S

Y

    

S

     

S

    

E

    

S

S

  

CH/HNZMD

   

S

     

S

 

H

   

S

  

V

 

E

    

S

S

 

A

CH/HNPY

A

  

S

Y

    

S

     

S

    

E

   

L

S

S

 Â