Skip to main content

Table 4 Analysis of amino acid mutations in epitopes domains of field strains and the CV777 attenuated vaccine strain (aa 498–637, aa 747–754 and aa 763–770 located in CV777 attenuated)

From: Detection and phylogenetic analysis of porcine epidemic diarrhea virus in central China based on the ORF3 gene and the S1 gene

Strains 499 500 514 516 520 522 526 530 543 548 561 572 583 587 590 593 604 607 608 611 632 634 636 751 762 763 765 766 768
CV777 attenuated T L S A H G I T R T S K K S L G E S G F Q V D G P L D G V
CV777      L S V           A    L E I     S Y   
CH/ZMDZY/11     S R   T    S    N    S      E      S S   
CH/HNHB-1 D    S       S       S      E      S S   
CH/HNHB-2, CH/HNHB-5    A S       S       S D   S   E      S S   
CH/HNHB-3   P   S       S       S      E      S S D  
CH/HNHB-4 A    S       S   N     S      E      S S   
CH/HNHB-6, CH/HNHB-7    A S       S       S D     E      S S   
CH/HNKF-1, CH/HNLY     S       S       S      E      S S   
CH/HNKF-2     S       S Y      S      E      S S   
CH/HNKF-3     S       S Y     P S      E      S S   
CH/HNSMX           S     T   S      E   G    S S   
CH/SXYC     S     A   S       S      E      S S   
CH/HNXC     S       S       S      V      S S   
CH/HNXX     S       S       S    V   E      S S   
CH/HNAY A    S Y      S       S      E     L S S   
CH/HNNY-1, CH/HNNY-2, CH/HNNY-3,     S Y      S       S      E      S S   
CH/HNZMD     S       S   H     S    V   E      S S   A
CH/HNPY A    S Y      S       S      E     L S S