Genotype (number of sequences analyzed) | I | II | III | IV | IX | V | VI | VII | XII | VIII | X | XI | XIII | XIV | XVI | XVII | XVIII |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
I (n = 113) |  | 0.009 | 0.009 | 0.008 | 0.008 | 0.011 | 0.010 | 0.012 | 0.010 | 0.008 | 0.013 | 0.011 | 0.011 | 0.013 | 0.011 | 0.012 | 0.012 |
II (n = 128) | 0.118 |  | 0.010 | 0.010 | 0.010 | 0.013 | 0.012 | 0.014 | 0.011 | 0.009 | 0.015 | 0.014 | 0.013 | 0.017 | 0.013 | 0.014 | 0.013 |
III (n = 9) | 0.103 | 0.118 |  | 0.008 | 0.009 | 0.011 | 0.010 | 0.012 | 0.010 | 0.010 | 0.013 | 0.012 | 0.011 | 0.014 | 0.011 | 0.013 | 0.011 |
IV (n = 6) | 0.101 | 0.115 | 0.074 |  | 0.008 | 0.010 | 0.009 | 0.011 | 0.008 | 0.010 | 0.010 | 0.011 | 0.010 | 0.012 | 0.009 | 0.011 | 0.011 |
IX (n = 25) | 0.104 | 0.120 | 0.081 | 0.073 |  | 0.011 | 0.010 | 0.012 | 0.010 | 0.010 | 0.012 | 0.012 | 0.011 | 0.014 | 0.011 | 0.012 | 0.011 |
V (n = 124) | 0.179 | 0.193 | 0.163 | 0.140 | 0.161 |  | 0.009 | 0.010 | 0.009 | 0.013 | 0.014 | 0.011 | 0.010 | 0.012 | 0.010 | 0.011 | 0.010 |
VI (n = 139) | 0.161 | 0.179 | 0.149 | 0.120 | 0.148 | 0.144 |  | 0.009 | 0.008 | 0.011 | 0.013 | 0.008 | 0.008 | 0.011 | 0.009 | 0.010 | 0.009 |
VII (n = 312) | 0.170 | 0.195 | 0.154 | 0.133 | 0.157 | 0.158 | 0.124 |  | 0.010 | 0.013 | 0.015 | 0.009 | 0.009 | 0.011 | 0.011 | 0.010 | 0.009 |
XII (n = 8) | 0.139 | 0.154 | 0.125 | 0.097 | 0.121 | 0.131 | 0.106 | 0.119 |  | 0.011 | 0.013 | 0.009 | 0.008 | 0.011 | 0.009 | 0.010 | 0.010 |
VIII (n = 4) | 0.104 | 0.109 | 0.118 | 0.114 | 0.114 | 0.185 | 0.166 | 0.175 | 0.151 |  | 0.014 | 0.013 | 0.012 | 0.015 | 0.012 | 0.013 | 0.013 |
X (n = 19) | 0.177 | 0.188 | 0.161 | 0.115 | 0.151 | 0.206 | 0.197 | 0.212 | 0.181 | 0.185 |  | 0.015 | 0.014 | 0.017 | 0.013 | 0.015 | 0.015 |
XI (n = 4) | 0.171 | 0.193 | 0.154 | 0.135 | 0.155 | 0.160 | 0.114 | 0.103 | 0.114 | 0.173 | 0.211 |  | 0.007 | 0.010 | 0.011 | 0.008 | 0.008 |
XIII (n = 27) | 0.167 | 0.189 | 0.154 | 0.129 | 0.146 | 0.154 | 0.121 | 0.105 | 0.115 | 0.173 | 0.203 | 0.096 |  | 0.009 | 0.010 | 0.008 | 0.007 |
XIV (n = 52) | 0.203 | 0.234 | 0.197 | 0.170 | 0.196 | 0.184 | 0.150 | 0.140 | 0.151 | 0.208 | 0.250 | 0.126 | 0.126 |  | 0.013 | 0.010 | 0.010 |
XVI (n = 4) | 0.151 | 0.172 | 0.142 | 0.111 | 0.139 | 0.152 | 0.138 | 0.154 | 0.118 | 0.157 | 0.191 | 0.150 | 0.141 | 0.180 |  | 0.012 | 0.011 |
XVII (n = 54) | 0.171 | 0.202 | 0.172 | 0.149 | 0.162 | 0.161 | 0.136 | 0.127 | 0.134 | 0.182 | 0.216 | 0.114 | 0.112 | 0.127 | 0.164 |  | 0.008 |
XVIII (n = 15) | 0.176 | 0.189 | 0.163 | 0.145 | 0.155 | 0.159 | 0.122 | 0.119 | 0.127 | 0.178 | 0.208 | 0.104 | 0.101 | 0.125 | 0.159 | 0.104 |  |