From: Nucleotide composition of the Zika virus RNA genome and its codon usage
AA | Codona | Number | Proportion | 4-groupa | 6-group1a | G/A | U/C | | | AA | Codona | Number | Proportion | 4-groupa | 6-groupa | G/A | U/C |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ala | GCG | 30 | 0.11 | C > A > U > G |  |  |  | | | Asn | AAU | 36 | 0.35 |  |  |  | C > U |
 | GCA | 80 | 0.28 |  |  |  |  | | |  | AAC | 68 | 0.65 |  |  |  |  |
 | GCU | 77 | 0.27 |  |  |  |  | | | Pro | CCG | 11 | 0.08 | A > C > U > G |  |  |  |
 | GCC | 96 | 0.34 |  |  |  |  | | |  | CCA | 65 | 0.46 |  |  |  |  |
Cys | UGU | 35 | 0.55 |  |  |  | U > C | | |  | CCU | 28 | 0.2 |  |  |  |  |
 | UGC | 29 | 0.45 |  |  |  |  | | |  | CCC | 38 | 0.27 |  |  |  |  |
Asp | GAU | 61 | 0.4 |  |  |  | C > U | | | Gln | CAG | 38 | 0.5 |  |  | G = A |  |
 | GAC | 93 | 0.6 |  |  |  |  | | |  | CAA | 38 | 0.5 |  |  |  |  |
Glu | GAG | 115 | 0.52 |  |  | G > A |  | | | Arg | AGG | 57 | 0.26 |  | A > G |  |  |
 | GAA | 107 | 0.48 |  |  |  |  | | |  | AGA | 93 | 0.42 |  |  |  |  |
Phe | UUU | 45 | 0.49 |  |  |  | C = U | | |  | CGG | 21 | 0.1 |  | C > G > U > A |  |  |
 | UUC | 46 | 0.51 |  |  |  |  | | |  | CGA | 11 | 0.05 |  |  |  |  |
Gly | GGG | 67 | 0.22 | A > G > C > U |  |  |  | | |  | CGU | 14 | 0.06 |  |  |  |  |
 | GGA | 150 | 0.49 |  |  |  |  | | |  | CGC | 24 | 0.11 |  |  |  |  |
 | GGT | 40 | 0.13 |  |  |  |  | | | Ser | AGU | 36 | 0.18 |  | C = U |  |  |
 | GGC | 51 | 0.17 |  |  |  |  | | |  | AGC | 38 | 0.19 |  |  |  |  |
His | CAU | 34 | 0.46 |  |  |  | C > U | | |  | UCG | 18 | 0.09 |  | A > U > C > G |  |  |
 | CAC | 40 | 0.54 |  |  |  |  | | |  | UCA | 50 | 0.25 |  |  |  |  |
Ile | AUA | 51 | 0.29 | Â | Â | Â | Â | | | Â | UCU | 29 | 0.15 | Â | Â | Â | Â |
 | AUU | 46 | 0.26 |  |  |  |  | | |  | UCC | 28 | 0.14 |  |  |  |  |
 | AUC | 78 | 0.45 |  |  |  |  | | | Thr | ACG | 20 | 0.09 | A > C > U > G |  |  |  |
Lys | AAG | 111 | 0.59 |  |  | G > A |  | | |  | ACA | 91 | 0.4 |  |  |  |  |
 | AAA | 77 | 0.41 |  |  |  |  | | |  | ACU | 53 | 0.23 |  |  |  |  |
Leu | UUG | 69 | 0.22 |  | G > A |  |  | | |  | ACC | 62 | 0.27 |  |  |  |  |
 | UUA | 20 | 0.06 |  |  |  |  | | | Val | GUG | 115 | 0.42 | G > C > U > A |  |  |  |
 | CUG | 94 | 0.3 |  | G > C > U > A |  |  | | |  | GUA | 31 | 0.11 |  |  |  |  |
 | CUA | 31 | 0.1 |  |  |  |  | | |  | GUU | 55 | 0.2 |  |  |  |  |
 | CUU | 46 | 0.15 |  |  |  |  | | |  | GUC | 70 | 0.26 |  |  |  |  |
 | CUC | 53 | 0.17 |  |  |  |  | | | Trp | UGG | 92 | 1 |  |  |  |  |
Met | AUG | 130 | 1 |  |  |  |  | | | Tyr | UAU | 38 | 0.44 |  |  |  | C > U |
 |  |  |  |  | | |  | UAC | 49 | 0.56 |  |  |  |  |