Table 1 Synonymous codon usage in Cardiovirus genome

EMCV

ThV

Ala

GCU(A)

1.21

GCU(A)

1.64

GCC(A)

1.45

GCC(A)

1.05

GCA(A)

0.80

GCA(A)

1.02

GCG(A)

0.54

GCG(A)

0.29

Arg

CGU(R)

0.91

CGU(R)

0.82

CGC(R)

0.74

CGC(R)

0.94

CGA(R)

0.28

CGA(R)

0.50

CGG(R)

0.61

CGG(R)

0.32

AGA(R)

2.60

AGA(R)

2.67

AGG(R)

0.87

AGG(R)

0.75

Asn

AAU(N)

1.17

AAU(N)

1.07

AAC(N)

0.83

AAC(N)

0.93

Asp

GAU(D)

1.17

GAU(D)

0.98

GAC(D)

0.83

GAC(D)

1.02

Cys

UGU(C)

0.97

UGU(C)

1.23

UGC(C)

1.04

UGC(C)

0.77

Gln

CAA(Q)

0.83

CAA(Q)

1.26

CAG(Q)

1.17

CAG(Q)

0.74

Glu

GAA(E)

0.93

GAA(E)

1.38

GAG(E)

1.07

GAG(E)

0.62

Gly

GGU(G)

1.06

GGU(G)

1.14

GGC(G)

0.92

GGC(G)

1.01

GGA(G)

1.25

GGA(G)

1.53

GGG(G)

0.77

GGG(G)

0.32

His

CAU(H)

1.23

CAU(H)

0.84

CAC(H)

0.77

CAC(H)

1.16

Ile

AUU(I)

1.61

AUU(I)

1.55

AUC(I)

0.66

AUC(I)

0.85

AUA(I)

0.73

AUA(I)

0.60

Leu

UUA(L)

0.43

UUA(L)

0.73

UUG(L)

1.40

UUG(L)

1.40

CUU(L)

0.95

CUU(L)

1.35

CUC(L)

1.03

CUC(L)

1.25

CUA(L)

0.78

CUA(L)

0.49

CUG(L)

1.41

CUG(L)

0.77

Lys

AAA(K)

0.83

AAA(K)

1.15

AAG(K)

1.17

AAG(K)

0.85

Phe

UUU(F)

1.10

UUU(F)

1.08

UUC(F)

0.90

UUC(F)

0.92

Pro

CCU(P)

1.04

CCU(P)

1.42

CCC(P)

1.12

CCC(P)

1.16

CCA(P)

1.37

CCA(P)

1.02

CCG(P)

0.47

CCG(P)

0.40

Ser

AGU(S)

0.60

AGU(S)

0.53

AGC(S)

0.52

AGC(S)

0.45

UCU(S)

1.57

UCU(S)

1.82

UCC(S)

1.36

UCC(S)

1.44

UCA(S)

1.40

UCA(S)

1.37

UCG(S)

0.55

UCG(S)

0.39

Thr

ACU(T)

1.27

ACU(T)

1.49

ACC(T)

1.31

ACC(T)

1.21

ACA(T)

1.13

ACA(T)

1.05

ACG(T)

0.29

ACG(T)

0.25

Tyr

UAU(Y)

0.99

UAU(Y)

0.94

UAC(Y)

1.01

UAC(Y)

1.06

Val

GUU(V)

0.90

GUU(V)

1.53

GUC(V)

0.96

GUC(V)

0.94

GUA(V)

0.66

GUA(V)

0.62

GUG(V)

1.48

GUG(V)

0.91