Untranslated region | Nucleotide mutation[a] | Secondary structure[c] | Polyprotein | Amino acid substitution[b] | Secondary structure[c] | |
---|---|---|---|---|---|---|
5'-UTR | S | T82C | Â | Lpro | A25T | Â |
 |  | T84C |  |  | Q26R |  |
 |  | C105T |  |  | T55A |  |
 |  | C119T |  |  | F68L |  |
 |  | T138C |  |  | Y73S |  |
 |  | A139G |  |  | P75H |  |
 |  | T145C |  |  | D81S |  |
 |  | T147C |  |  | K144Q |  |
 |  | C155T |  |  | Q146H |  |
 |  | C160T |  | VP2 | G72S | B-C loop, antigenic site 2 |
 |  | C182T |  |  | E136G | E-F loop |
 |  | T199- |  |  | K175R | G-H loop |
 |  | A200- |  |  | F214L | C terminus |
 |  | T222C |  | VP3 | A174S | G-H loop |
 |  | C238T |  | VP1 | Y72C | βD strand |
 |  | C280T |  |  | T96A | E-F loop |
 |  | T288C |  |  | G137D | G-H loop, close to antigenic site 1 |
 |  | T327C |  |  | T142A | G-H loop, antigenic site 1 |
 |  | C345T |  |  | A152T | G-H loop, antigenic site 1 |
 | PKs | T26C |  |  | Q153P | G-H loop, antigenic site 1 |
 |  | A51G |  |  | I168V | H-I loop |
 |  | A52T |  |  | A199T | C terminus, antigenic site 1 |
 |  | T114C |  |  | L212S | C terminus |
 |  | C121T |  | 2B | S5A |  |
 |  | T132C |  |  | K48R |  |
 |  | T193C |  | 2C | K64E |  |
 | cre | A30G |  |  | V92A |  |
 |  | T33C |  |  | I241T |  |
 | IRES | T55C | Domain 2 |  | S312N |  |
 |  | C228T | Domain 3 | 3A | I3V |  |
 |  | C275T | Domain 3 |  | H31C |  |
 |  | T312C | Domain 4 |  | I34V |  |
 |  | C389T | Domain 4 |  | I42V |  |
 |  | T423C |  |  | E57D |  |
 |  | A428C |  |  | I72M | Transmembrane domain |
 |  | C436T |  |  | M85T |  |
 |  | T437C |  |  | A89V |  |
 |  | -442A |  |  | N91D |  |
3'-UTR | C32T | Â | Â | I94T | Â | |
 | A91G |  |  | T100A |  | |
 |  | E108G |  | |||
 |  | N112S |  | |||
 |  | K144E |  | |||
 |  | E148G |  | |||
 | 3B1 | K18R |  | |||
 | 3Cpro | R196K |  | |||
 | 3D | H27Y |  | |||
 |  | K42Q |  | |||
 |  | G62E |  | |||
 |  | N63D |  | |||
 |  | T98I |  | |||
 |  | Q210R |  | |||
 |  | R234K |  | |||
 |  | R440W |  |