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Table 1 Oligonucleotides used for cloning and sequencing of the IHNV genome

From: Molecular characterization of the virulent infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV) strain 220-90

IHNV primers

Sequences

Position

IHNV 1F

GTATAAGAAAAGTAACTTGAC

1-21

IHNV 1R

CTTCCCTCGTATTCATCCTC

2097-2078

IHNV 2F

GCAGGATCCCAAGAGGTGAAG

2033-2053

IHNV 2R

GGAACGAGAGGATTTCTGATCC

3819-3818

IHNV 3F

CAGTGGATACGGACAGATCTC

3767-3787

IHNV 3R

CTTGGGAGCTCTCCTGACTTG

5579-5559

IHNV 4F

GTACTTCACAGATCGAGGATCG

5523-5544

IHNV 4R

CGGGGACTCTTGTTCTGGAATG

7147-7128

IHNV 5F

CGTACCAGTGGAAATACATCGG

7098-7119

IHNV 5R

CAGGTGGTGAAGTAGGTGTAG

9018-8997

IHNV 6F

GAGGGAGTTCTTTGATATTCCC

8931-8952

IHNV 6R

ATAAAAAAAGTAACAGAAGGGTTCTC

11130-11105

IHNV NheR

CGTTTCTGCTAGCTTGTTGTTGG

525-503

IHNV 1MF

ACAGAAGCTAACCAAGGCTAT

729-749

IHNV 2MF

AGATCCCAATGCAGACCTACT

2610-2630

IHNV 3MF

GTATCAGGGATCTCCATCAG

4322-4341

IHNV 4MF

GATACATAAACGCATACCACA

6113-6133

IHNV 5MF

TCAGAGATGAAGCTCAGCAA

7546-7565

IHNV 6MF

AACACCATGCAGACCATACTC

9559-9579

IHNV 5'End

CGATATTGAAGAGAAAGGAATAAC

10692-10715

Oligo (dT)

GCGGCCGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT

Â