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Table 3 Dynamic changes of amino acid residues at antigenic and N- glycosylation sites of influenza A(H1N1)pdm09-HA in Tunisia

From: Genetic diversity of HA1 domain of heammaglutinin gene of influenza A(H1N1)pdm09 in Tunisia

 

Antigenic sites

 

Ca

 

Virus strains

HA1

Ca1

Ca2

Sa

Sb

N-glycosylation

321

138

203

205

222

162

183

185

288

276

A/California/07/2009

I

H

S

R

D

S

S

S

T

N

A/Tunisia/59/2009

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/15656/2009

V

-

-

-

-

-

-

-

-

H

A/Tunisia/16501/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/17053/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/18792/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/18861/2009

V

-

T

K

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/18970/2009

V

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19073/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19112/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19436/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19530/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19703/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19922/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/19966/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20043/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20083/2009

V

-

-

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20108/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20112/2009

V

-

T

-

E

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20108/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/20558/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/21001/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/21516/2009

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/1064/2010

V

-

T

K

G

-

-

-

-

-

A/Tunisia/197/2011

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/200/2011

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/217/2011

V

-

T

K

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/331/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/422/2011

V

-

T

-

-

-

P

-

-

-

A/Tunisia/755/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/757/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/932/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1010/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1011/2011

V

-

T

-

-

-

P

-

-

-

A/Tunisia/1060/2011

V

-

T

-

-

-

P

-

-

-

A/Tunisia/1198/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1411/2011

V

-

T

-

G

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1423/2011

V

Q

T

K

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/1909/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1871/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1870/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1713/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1701/2011

V

-

T

-

G

-

-

T

-

-

A/Tunisia/1713/2011

V

-

T

-

-

-

-

-

-

-

A/Tunisia/2133/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2137/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2139/2011

V

-

T

K

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2140/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2141/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2144/2011

V

-

T

-

-

I

P

-

N

-

A/Tunisia/2210/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-

A/Tunisia/2222/2011

V

-

T

-

-

-

-

T

-

-