Domain: HPV16 E6 sequence | Domain: HPV16 E7 sequence | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
nt | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | n | nt | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | 7 | n |
1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 3 | 5 | 6 | 6 | 7 | 7 | 8 | 8 | 8 | 8 | ||||
3 | 3 | 1 | 1 | 2 | 3 | 6 | 9 | 4 | 8 | 8 | 0 | 9 | 0 | 3 | 8 | 8 | ||||
6 | 7 | 0 | 8 | 0 | 0 | 1 | 2 | 9 | 8 | 9 | 8 | 1 | 2 | 2 | 5 | 8 | ||||
NC001526 | G | A | C | G | T | G | G | T | G | NC001526 | A | A | G | C | T | C | T | T | ||
MZ546266 | G | 1 | MZ546295 | G | T | C | C | 1 | ||||||||||||
MZ546267 | A | A | 2 | MZ546296 | A | T | 2 | |||||||||||||
MZ546268 | G | 2 | MZ546297 | G | T | C | 2 | |||||||||||||
MZ546269 | 2 | MZ546298 | T | 2 | ||||||||||||||||
MZ546270 | G | 1 | MZ546299 | T | 1 | |||||||||||||||
MZ546271 | 2 | MZ546300 | A | T | 2 | |||||||||||||||
MZ546272 | 1 | MZ546301 | T | C | 1 | |||||||||||||||
MZ546273 | A | A | 1 | MZ546302 | A | 1 | ||||||||||||||
MZ546274 | A | G | A | 1 | MZ546303 | A | 1 | |||||||||||||
MZ546275 | A | 1 | MZ546304 | C | 1 | |||||||||||||||
MZ546276 | G | A | G | 1 | MZ546305 | C | 1 | |||||||||||||
MZ546277 | T | 1 | MZ546306 | C | 1 | |||||||||||||||
MZ546278 | C | 2 | MZ546307 | 2 | ||||||||||||||||
Reference aa | K | R | T | D | D | E | R | L | R | N | N | E | S | L | R | C | S | |||
aa position | 1 | |||||||||||||||||||
2 | 3 | 3 | 3 | 4 | 9 | 4 | 2 | 2 | 3 | 6 | 6 | 7 | 9 | 9 | ||||||
4 | 5 | 9 | 2 | 2 | 6 | 6 | 0 | 2 | 9 | 9 | 5 | 3 | 7 | 7 | 4 | 5 | ||||
aa mutations | G | S | N/Y | E | Q | Q | V | Q | H | S | F | C | ||||||||
Frequency | 4 | 1 | 1 | 2 | 5 | 2 | 1 | 2 | 2 | 18 | 1 | 3 | 6 | 9 | 3 | 2 | 1 | 3 | 18 |