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Table 1 Primers used for SNP typing

From: Relationship between polymorphism of receptor SCARB2 gene and clinical severity of enterovirus-71 associated hand-foot-mouth disease

SNP ID

2nd-PCRP

1st-PCRP

Extension of primers

Amplified fragment length (bp)

rs1051326

ACGTTGGATGAGTGAGTGACAGTGAGCTAC

ACGTTGGATGTATTTCTTCTGGGACAGCCG

GAGGAAGGAACTTGTAAAAA

127

rs11547135

ACGTTGGATGAGAGCTGCGCGCACGAACC

ACGTTGGATGATCCAACTGCAAGGAGGGAG

cccctCGCCGAAGGGTCCCG

125

rs121909118

ACGTTGGATGTGACCAGAGTCCACATTCAC

ACGTTGGATGACTTTATACCGAAAGGCAGG

TTTCAGTGACTATGAGAGTGTA

129

rs121909119

ACGTTGGATGGAGATATCGGGCCTGAAAAC

ACGTTGGATGCAGCAGAAGCTCTTTGTGAC

GATTTCATCTTTGTAGCCC

118

rs1465922

ACGTTGGATGAAGGAAACCGAAACCGAGTC

ACGTTGGATGTTCGTGCGCGCAGCTCTGG

taCCGGTGCACCCGGGG

126

rs1465923

ACGTTGGATGATCCCTAGGTTGCTGCAAAG

ACGTTGGATGTCCCAGAAGTCTGGCATCTC

atgcGCACAGCAGGGATACTAAGGC

131

rs1470194

ACGTTGGATGGGTTGGTGTAGGTGAATTAG

ACGTTGGATGACTGAAGCTTCTACCTCCTG

cccacGTTTACTGGGCCAGCCCAGG

136

rs200053119

ACGTTGGATGTCTGCTGTTAGCAACAAGGC

ACGTTGGATGGCCTACTTACCAATACAGGA

AACAAGGCCTATGTTTTTGAA

126

rs2119733

ACGTTGGATGCAAGTCTGAAACCCAACAGG

ACGTTGGATGACCAGTGTGCTCTGGATGTG

ACAGGGCAGTTATTAAATC

111

rs2869851

ACGTTGGATGATGCCAGTCACTGTCCTAAG

ACGTTGGATGAATACAAGCATGAGCCACCG

gttgACATATTTACATGTAGTTAATGC

139

rs3733255

ACGTTGGATGAAACTGTGTGAGCTGTCCTG

ACGTTGGATGGGCCAGAATGTTCCTATCAC

TGTTGAAAGAAGGAAAAAGACAC

145

rs3733256

ACGTTGGATGGGCCAGAATGTTCCTATCAC

ACGTTGGATGAAACTGTGTGAGCTGTCCTG

aTGCAAGGAGGTGGAG

145

rs57374265

ACGTTGGATGGTCAGGGTTCATCCATGTTG

ACGTTGGATGGTGGTATATCTACACAACGG

CATCCATGTTGTAGCATGTAT

105

rs6811781

ACGTTGGATGAGAGAGTCTCACTCTGTCGC

ACGTTGGATGTGGCTGAGGCAGGAGAATTG

gcttCAACCTCTGCCTCCC

120

rs6812193

ACGTTGGATGACTTGATCATGGACTCCACC

ACGTTGGATGTGCAGTGGTTAATAACATGG

GGGAAAGCTGGATTTGAA

112

rs6824953

ACGTTGGATGTCCCAATGTACTGGAAGCTC

ACGTTGGATGTAAACCACAGTTGAAGATG

gggttGGGTGCAGTGACCAAGTCCTTT

137

rs6841815

ACGTTGGATGTGGCTGAGGCAGGAGAATTG

ACGTTGGATGAGAGAGTCTCACTCTGTCGC

AGTGAGCCGAGATCA

120

rs727502772

ACGTTGGATGTCTGAGTCTGAAAACACCCG

ACGTTGGATGAGTGAAACGGGAGACATTAG

TCCGTCTCAGGACTTA

119

rs727502781

ACGTTGGATGGGACTACACAGAAATGGTGC

ACGTTGGATGGATTTGGAACCTCTTGGCTG

gccgTTTCACTTCTCTGATTTGC

149

rs72857048

ACGTTGGATGGGAGGAATCCTGTCTTTTAC

ACGTTGGATGTGATCATGCCACTGCATTCC

AAGTCTTGCTCTGTTGC

134

rs75285019

ACGTTGGATGTAGAGACTGCAGCTACTAAG

ACGTTGGATGGAGAAGACTCTATCCTAGGC

tgtTGGAGATCGAAGCTATAAT

106

rs755903502

ACGTTGGATGCTCTCTTCTGTGTTTCAGGG

ACGTTGGATGAGGACAGCTCACACAGTTTC

gggttTGTTTCAGGGAACAGCGGATG

118

rs7697073

ACGTTGGATGATCTGACTCCAAATCTCACG

ACGTTGGATGTAAGGTGTGATCTTTCTGGG

TCTAATAAAAATAAAGTTGCTATCAC

124

rs78737354

ACGTTGGATGATGCCTTGCAACTTCTGCTG

ACGTTGGATGATGTTCTCTGCAGCAGTCTC

acccGGAGCCTCAAGTCACC

118

rs886041074

ACGTTGGATGATGATCTCCCTGAGGAAGTG

ACGTTGGATGGGGATGCTGCTGTCTTAATA

actgtGACCACTCTATGACAGTC

100

rs886041076

ACGTTGGATGGACAGTTACCTTAACTTTAC

ACGTTGGATGCTGAAAAAATAATTCCACTG

tggGGAATGGAATGGGAAAAC

105

rs886041078

ACGTTGGATGTTTCTTGCCTCTCCAGAGTG

ACGTTGGATGGTAGGGTATGTTGGTGATG

AAAGAGACGGCGAGT

117

rs8475

ACGTTGGATGCATTTAACTAGATAATTGGGC

ACGTTGGATGCCTGATAATAGGACTAAACC

ggggAGATAATTGGGCATGTCTTA

125