Genes | Molecular determinants of virulence | Molecular determinants of host specificity and host pathogenicity | Molecular determinants of drug resistance | Miscellaneous | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sites | ALG | HK-G1 | Virulent | Sites | ALG | HK-G1 | Mammalian preference | sites | ALG | HK-G1 | ||
PB2 | 89 | V | V | L | 44 | A | A | S | ||||
147 | V | M | L | 64 | M | M | T | |||||
250 | V | V | G | 81 | T | T | M | |||||
253 | D | D | N | 158 | E | E | G | |||||
404 | F | F | L | 190 | K | R | K | |||||
504 | V | V | V | 199 | A | A | S | |||||
271 | T | T | A | |||||||||
318 | R | K | R | |||||||||
339 | K | K | T | |||||||||
526 | K | K | R | |||||||||
543 | E | E | D | |||||||||
588 | A | A | V | |||||||||
590 | S | S | ||||||||||
591 | Q | Q | K | |||||||||
627 | E | E | K | |||||||||
643 | S | S | T | |||||||||
655 | V | A | V | |||||||||
661 | T | T | A | |||||||||
666 | T | T | I | |||||||||
701 | D | D | N | |||||||||
702 | Q | K | R | |||||||||
714 | S | S | R | |||||||||
PB1 | 105 | N | N | S | 13 | P | P | P | ||||
317 | M | I | I | 207 | K | K | R | |||||
577 | K | K | E | 336 | V | V | I | |||||
622 | G | G | G | 375 | N | N | S | |||||
436 | Y | Y | H | |||||||||
578 | K | K | Q | |||||||||
677 | T | T | M | |||||||||
PB1-F2 | Truncated protein of 52 aa | |||||||||||
PA | 127 | V | V | V | 28 | P | P | L | ||||
550 | L | L | L | 44 | V | V | I | |||||
672 | L | L | L | 55 | D | D | N | |||||
57 | R | R | Q | |||||||||
63 | V | V | I | |||||||||
97 | T | T | I | |||||||||
100 | I | V | A | |||||||||
133 | E | E | G | |||||||||
142 | K | K | N/E | |||||||||
225 | S | S | C | |||||||||
241 | C | C | Y | |||||||||
268 | L | L | I | |||||||||
312 | R | K | R | |||||||||
343 | A | A | S | |||||||||
347 | D | D | E | |||||||||
356 | K | K | R | |||||||||
382 | E | E | D | |||||||||
383 | D | D | D | |||||||||
400 | T | L | L | |||||||||
404 | A | A | S | |||||||||
409 | N | S | N | |||||||||
515 | T | T | T | |||||||||
552 | T | T | S | |||||||||
556 | Q | Q | R | |||||||||
573 | I | I | V | |||||||||
615 | K | R | N | |||||||||
PA-X | Full length 252 aa | |||||||||||
NP | 210 | D | D | D | 31 | R | R | K | ||||
33 | V | V | I | |||||||||
34 | G | G | N | |||||||||
61 | I | I | L | |||||||||
100 | R | R | V | |||||||||
109 | I | I | V | |||||||||
127 | E | E | D | |||||||||
136 | M | M | M | |||||||||
214 | R | R | K | |||||||||
283 | L | L | P | |||||||||
293 | R | R | K | |||||||||
305 | R | R | K | |||||||||
313 | F | F | Y | |||||||||
357 | Q | Q | K | |||||||||
372 | D | E | D | |||||||||
375 | D | D | G/E | |||||||||
398 | Q | Q | Q | |||||||||
422 | R | R | K | |||||||||
430 | K | K | ||||||||||
442 | T | T | A | |||||||||
455 | D | D | E | |||||||||
480 | D | D | ||||||||||
M1 | 30 | D | D | D | 15 | I | I | I | ||||
43 | M | M | M | 115 | V | R | I | |||||
215 | A | A | A | 121 | T | T | A | |||||
137 | T | T | A | |||||||||
M2 | 64 | S | S | S/A/F | 11 | T | T | I | 26 | L | L | |
69 | P | P | P | 16 | D | G | G/D | 27 | V | V | ||
28 | V | V | I/V | 31 | N | S | ||||||
55 | F | F | F | 34 | G | G | ||||||
57 | Y | Y | H | 38 | L | L | ||||||
86 | V | V | A | |||||||||
NS1 | 42 | S | S | S | 227 | G | E | K/R | Non 80TIASV84 deletion GSEV PL motif | |||
92 | D | E | E | |||||||||
103 | L | L | F | |||||||||
106 | M | I | M | |||||||||
149 | A | A | A | |||||||||
189 | D | D | N | |||||||||
NS2 | 31 | M | M | I | ||||||||
56 | H | H | Y |