Table 5 Detection of AIV, NDV, IBV and IBDV strains with use of real-time RT-PCR and microarray
From: New oligonucleotide microarray for rapid diagnosis of avian viral diseases
№ | Virus | Real-time RT-PCR | Microarray | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AIV | NDV | IBV | IBDV | AIV | NDV | IBV | IBDV | ||
1 | “A/duck/Alberta/35/76” (H1N1) (AIV) | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − |
2 | “A/duck/Germany/215” (H2N3) (AIV) | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − |
3 | “A/duck/California/72” (H3N8) (AIV) | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − |
4 | “A/duck/Czechoslovakia/56” (H4N6) (AIV) | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − |
5 | “Vinterfild “(IBDV) | − − − | − − − | - | +++ | − − − | − − − | - | +++ |
6 | “BG” (IBDV) | − − − | − − − | - | +++ | − − − | − − − | - | +++ |
7 | “201” (IBDV) | − − − | − − − | - | +++ | − − − | − − − | - | +++ |
8 | “Koktal” (IBDV) | − − − | − − − | - | +++ | − − − | − − − | - | +++ |
9 | “52/70” (IBDV) | − − − | − − − | - | +++ | − − − | − − − | - | +++ |
10 | “H-120” (IBV) | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − |
11 | “10-95” (IBV) | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − |
12 | “63/00” (NDV | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − |
13 | “52/98” (NDV) | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − |
14 | “Bor-74 VGNKI “(NDV) | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − |
15 | “Columba livia /KZ/EKO/15/2014” (NDV) | − − − | +++ | − − − | − − − | − − − | +++ | − − − | − − − |