Virology Journal

Table 1 Primers used for qRT-PCR

From: Transcriptome analysis of Cucumis sativus infected by Cucurbit chlorotic yellows virus

Gene name	Gene primer for qRT-PCR (5′ → 3′)
Csa1G009810	S^a: ATTTGACCCGTTGGGATTAG
Csa1G009810	A^b: GTTGACGACGAGGCGAAGTA
Csa3G099680	S^a: GAGTTCCCTGGTGATTATGG
Csa3G099680	A^b: TCTAAGACTTCGGGTGTTATG
Csa6G445760	S^a: CCTCTTCGTGGAACCATTAC
Csa6G445760	A^b: AACAATAGAAGCCAATCCTG
Csa3G645940	S^a: CTACTACCTCCGACAACGC
Csa3G645940	A^b: CACAGAGGCAGATTTCTCAT
Csa3G730800	S^a: ATAATCACGCCAAGCCTCAG
Csa3G730800	A^b: CACCGACACCGAACAATCCT
Csa3G836520	S^a: GGCTTTCCAATAACAACACT
Csa3G836520	A^b: ACCATTCGCCATATCTTCTG
Csa1G264550	S^a: CCCCTTTGCTAAGGAACCTA
Csa1G264550	A^b: TGTATGGCATCCCACTGTAT
Csa1G423100	S^a: CCAACGGCCAAAGATTCTAC
Csa1G423100	A^b: ATTGCAGCGATCATACTCGA
Csa2G179730	S^a: AGGGAGGCGATAGTGGAATA
Csa2G179730	A^b: GGCGGATAGTAATGACAGAACA
Csa2G295430	S^a: ACGATGCGTGGGATGGGTAG
Csa2G295430	A^b: AGCGTGGCAGGTTCCAGAAG
Csa6G217470	S^a: CACCACCGCTGACACTGACT
Csa6G217470	A^b: GGACGATGCTCGACCAAAG
Csa6G318690	S^a: GAGCAGCCTCCAAGGATAAG
Csa6G318690	A^b: TACGGACGCCAAGTTGTTAT
CsUBIF	S^a: CACCAAGCCCAAGAAGATC
CsUBIR	A^b: TAAACCTAATCACCACCAGC

^a S sense
^b A antisense

Back to article page

ISSN: 1743-422X

Contact us

Submission enquiries: journalsubmissions@springernature.com