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Table 4 Pearson’s correlation coefficients (r) for hydrophaty index in gp41 alignments of R5, X4, and R5X4 sequencesa

From: Statistical correlation of nonconservative substitutions of HIV gp41 variable amino acid residues with the R5X4 HIV-1 phenotype

   R5 X4 R5X4
 Position 1 Position 2 r p r p r p
535 619 −0.18 5.7E-06 −0.38 5.5E-04 −0.31 4.3E-03
535 636 0.26 5.7E-11 0.32 3.2E-03 0.29 6.9E-03
535 641 −0.23 8.1E-09 −0.34 1.8E-03 −0.18 5.3E-02
535 662 0.15 7.7E-05 0.36 7.9E-04 0.11 1.8E-01
535 723 −0.29 2.7E-13 −0.47 2.0E-05 −0.27 9.6E-03
535 756 −0.26 8.8E-11 −0.39 2.7E-04 −0.25 1.6E-02
602 619 −0.20 3.3E-07 −0.16 8.3E-02 −0.14 9.4E-02
602 640 −0.22 2.4E-08 −0.15 1.1E-01 −0.44 5.9E-05
602 641 −0.17 7.4E-06 −0.11 1.7E-01 −0.16 8.1E-02
602 662 0.20 9.6E-07 0.20 4.5E-02 0.22 2.1E-02
602 723 −0.22 3.3E-08 −0.10 2.1E-01 −0.40 1.8E-04
602 756 −0.18 4.2E-06 −0.25 1.5E-02 −0.34 1.2E-03
619 636 −0.28 4.3E-12 −0.38 3.6E-04 −0.28 7.6E-03
619 640 0.20 2.6E-07 0.17 7.9E-02 0.47 2.6E-05
619 641 0.20 2.2E-07 0.24 2.0E-02 0.10 1.9E-01
619 658 0.16 2.9E-05 0.21 3.6E-02 0.16 8.2E-02
619 662 −0.45 2.0E-29 −0.51 1.4E-05 −0.54 6.4E-07
619 723 0.45 6.3E-29 0.44 1.1E-04 0.45 3.8E-05
619 756 0.41 2.2E-24 0.39 4.5E-04 0.45 2.1E-05
619 841 0.25 2.5E-10 −0.03 3.8E-01 0.36 6.4E-04
636 640 −0.24 4.0E-09 −0.20 3.8E-02 −0.58 2.3E-07
636 641 −0.35 6.7E-18 −0.19 5.1E-02 −0.30 3.6E-03
636 662 0.19 1.2E-06 0.28 1.0E-02 0.21 2.8E-02
636 723 −0.53 1.7E-37 −0.42 2.0E-04 −0.28 7.6E-03
636 756 −0.48 1.4E-35 −0.31 4.0E-03 −0.23 2.3E-02
640 641 0.28 1.7E-13 0.35 1.5E-03 0.35 1.2E-03
640 662 −0.21 4.3E-08 −0.31 3.9E-03 −0.48 1.4E-05
640 723 0.35 3.3E-18 0.35 1.1E-03 0.39 3.5E-04
640 756 0.29 1.5E-12 0.16 8.8E-02 0.45 1.9E-05
641 723 0.40 1.8E-23 0.52 7.0E-06 0.23 2.6E-02
641 756 0.36 6.4E-19 0.20 3.9E-02 0.16 7.3E-02
658 662 −0.18 2.5E-06 −0.26 1.1E-02 −0.13 1.2E-01
658 723 0.26 3.2E-10 0.09 2.5E-01 −0.16 7.2E-02
658 756 0.21 3.4E-07 0.08 2.4E-01 0.16 7.2E-02
662 723 −0.45 1.5E-29 −0.42 1.5E-04 −0.49 6.9E-06
662 756 −0.40 4.6E-24 −0.45 6.0E-05 −0.44 2.7E-05
662 841 −0.36 1.5E-19 −0.12 1.3E-01 −0.23 2.2E-02
723 756 0.71 1.5E-66 0.61 1.3E-07 0.67 1.5E-09
723 841 0.20 3.0E-07 0.03 4.3E-01 0.10 2.0E-01
756 841 0.24 1.5E-09 0.07 2.8E-01 0.19 4.9E-02
  1. a Only correlations with a p-value less than .0001 for at least one coreceptor group are shown