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Table 4 Accession numbers and reference of 106 sequences used in the phylogenetic tree

From: Phylogenetic analysis of torque teno virus genome from Pakistani isolate and incidence of co-infection among HBV/HCV infected patients

S No. NCBI accession No. Isolate name Reference
1. AB017610 TA278 Okamoto et al ., 1998b[8]
2. AY823988 2 h Niel et al ., 2005[22]
3. AY823989 3 h Niel et al ., 2005[22]
4. AY666122 HEL32 Qiu et al ., 2005[11]
5. AB017613 TUS01 Okamoto et al ., 1999c[33]
6. AF261761 PMV Hallet et al ., 2000[25]
7. AB054647 Kt-08f Muljono et al ., 2001[23]
8. AB054648 Kt-10f Muljono et al ., 2001[23]
9. AF435014 KAV Heller et al ., 2001[26]
10. GU797360 BIS8-17 Unpublished
11. DQ187006 BM1C-18 Unpublished
12. AB064595 CT23F Peng et al ., 2002[28]
13. AB064596 CT25F Peng et al ., 2002[28]
14. AB064597 CT30F Peng et al ., 2002[28]
15. AB064604 CT39F Peng et al ., 2002[28]
16. AB064598 CT43F Peng et al ., 2002[28]
17. NC014075 CT44F Peng et al ., 2002[28]
18. AF122913 GH1 Mushahwar et al ., 1999[3]
19. AF122916 JA1 Erker et al ., 1999[5]
20. AF122918 JA2b Erker et al ., 1999[5]
21. AF122917 JA4 Erker et al ., 1999[5]
22. AF122915 JA9 Erker et al ., 1999[5]
23. AF122919 JA10 Erker et al ., 1999[5]
24. AF122914.3 JA20 Erker et al ., 1999[5]
25. AB064599 JT03F Peng et al ., 2002[28]
26. AB064600 JT05F Peng et al ., 2002[28]
27. AB064601 JT14F Peng et al ., 2002[28]
28. AB064602 JT19F Peng et al ., 2002[28]
29. AB064606 JT33F Peng et al ., 2002[28]
30. NC_014076 JT34F Peng et al ., 2002[28]
31. AB064603 JT41F Peng et al ., 2002[28]
32. AY026465 L01 Liu et al ., 2002[43]
33. AY026466 L02 Liu et al ., 2002[43]
34. AF371370 L03 Liu et al ., 2002[43]
35. NC014069 NC014069 Unpublished
36. AF298585 P1C1 Unpublished
37. AB060597 SAa-01 Okamoto et al ., 2001[23]
38. AB060594 SAa-10 Okamoto et al ., 2001[23]
39. AB060593 SAa-38 Okamoto et al ., 2001[23]
40. AB060592 SAa-39 Okamoto et al ., 2001[23]
41. AB060596 SAf-09 Okamoto et al ., 2001[23]
42. AB060595 SAj-30 Okamoto et al ., 2001[23]
43. AB025946.2 SANBAN Hijikata et al ., 1999[40]
44. AM712003 Sle1931 Leppik et al ., 2007[45]
45. AM712004 Sle1932 Leppik et al ., 2007[45]
46. AM711976| Sle1957 Leppik et al ., 2007[45]
47. AM712030 Sle2057 Leppik et al ., 2007[45]
48. AM712031 Sle2058 Leppik et al ., 2007[45]
49. AM712033 Sle2061 Leppik et al ., 2007[45]
50. AM712034 Sle2065 Leppik et al ., 2007[45]
51. AM712032 Sle2072 Leppik et al ., 2007[45]
52. AF247138 T3PB Biagini et al ., 2000
53. AF345526 TCHN-A Luo et al ., 2002[44]
54. AF348409 TCHN-B Luo et al ., 2002[44]
55. AF345523 TCHN-C1 Luo et al ., 2002[44]
56. AF345527 TCHN-C2 Luo et al ., 2002[44]
57. AF345524 TCHN-D1 Luo et al ., 2002[44]
58. AF345525 TCHN-D2 Luo et al ., 2002[44]
59. AF345522 TCHN-E Luo et al ., 2002[44]
60. AF345528 TCHN-F Luo et al ., 2002[44]
61. AF345521 TCHN-G1 Luo et al ., 2002[44]
62. AF345529 TCHN-G2 Luo et al ., 2002[44]
63. AB028668 TJN01 Ukita et al ., 2000[46]
64. AB028669 TJN02 Ukita et al ., 2000[46]
65. AJ620218 TTH3 Jelcic et al ., 2004[27]
66. AJ620226 TTH4 Jelcic et al ., 2004[27]
67. AJ620227 TTH5 Jelcic et al ., 2004[27]
68. AJ620212 TTH6 Jelcic et al ., 2004[27]
69. AJ620230 TTH7 Jelcic et al ., 2004[27]
70. AJ620231 TTH8 Jelcic et al ., 2004[27]
71. AJ620219 TTH9 Jelcic et al ., 2004[27]
72. AJ620213 TTH10 Jelcic et al ., 2004[27]
73. AJ620214 TTH11 Jelcic et al ., 2004[27]
74. AJ620232 TTH13 Jelcic et al ., 2004[27]
75. AJ620228 TTH14 Jelcic et al ., 2004[27]
76. AJ620220 TTH16 Jelcic et al ., 2004[27]
77. AJ620221 TTH17 Jelcic et al ., 2004[27]
78. AJ620215 TTH18 Jelcic et al ., 2004[27]
79. AJ620233 TTH19 Jelcic et al ., 2004[27]
80. AJ620216 TTH20 Jelcic et al ., 2004[27]
81. AJ620217 TTH21 Jelcic et al ., 2004[27]
82. AJ620234 TTH22g4 Jelcic et al ., 2004[27]
83. AJ620235 TTH23 Jelcic et al ., 2004[27]
84. AJ620222 TTH25 Jelcic et al ., 2004[27]
85. AJ620223 TTH26 Jelcic et al ., 2004[27]
86. AJ620224 TTH27 Jelcic et al ., 2004[27]
87. AJ620229 TTH29 Jelcic et al ., 2004[27]
88. AJ620225 TTH31 Jelcic et al ., 2004[27]
89. FR751471 TTV-HD14i de Villiers et al ., 2011[47]
90. FR751472 TTV-HD15a de Villiers et al ., 2011[47]
91. FR751476 TTV-HD16a de Villiers et al ., 2011[47]
92. FR751488 TTV-HD17 de Villiers et al ., 2011[47]
93. FR751489 TTV-HD18a de Villiers et al ., 2011[47]
94. FR751491 TTV-HD19 de Villiers et al ., 2011[47]
95. FR751492 TTV-HD20a de Villiers et al ., 2011[47]
96. FR751498 TTV-HD21 de Villiers et al ., 2011[47]
97. FR751499 TTV-HD22 de Villiers et al ., 2011[47]
98. FR751500 TTV-HD23a de Villiers et al ., 2011[47]
99. FR751506 TTV-HD24a de Villiers et al ., 2011[47]
100. AB038620 TTVsan-s039 Takahashi et al ., 2000[48]
101. AB038621 TTVyon-Kc009 Takahashi et al ., 2000[48]
102. AF247137 TUPB Biagini et al ., 2000[49]
103. AB050448 TYM9 Okamoto et al ., 2000[50]
104. AF122921 US32 Erker et al ., 1999[5]
105. AF122920 US35 Erker et al ., 1999[5]
106. DQ361268 ViPi04 Maggi et al ., 2006[24]