Segments | Primers | Oligonucleotide sequence (5'-3') | Positiona | Length (bp) | Annealing temperature (°C) |
---|---|---|---|---|---|
S1 | P1Sb | 5'--- AGAAGTTTATCTGTGTGGACTTC---3' | 1-23 | 1795 | 58 |
 | P1Rc | 5'--- CCACCACGATGGCTCCTGC---3' | 1777-1795 |  |  |
S2 | P2S | 5'--- TGYTGGTCGCTCCGGCTTA---3' | 956-974 | 1582 | 57 |
 | P2R | 5'--- AAGATGCCACTTCCACAYCTC ---3' | 2517-2537 |  |  |
S3 | P3S | 5'--- GACACTGGATGTGCCATTG---3' | 2479-2497 | 2310 | 57 |
 | P3R | 5'---TCTTTTTGTTGTTTTTAAAG---3' | 4589-4608 |  |  |
S4 | P4S | 5'--- GTTGGACGACGACGGCGACTTTC---3' | 4449-4471 | 2648 | 58 |
 | P4R | 5'--- AGGTGATTAGGTGCTTCAGGAGAGG---3' | 7072-7096 |  |  |
S5 | P5S | 5'--- GGTCGGAGTGGTGGCAGCAAATG---3' | 6894-6916 | 2200 | 58 |
 | P5R | 5'--- CCCTTTAGCCTTTCCGAACTCTCCG---3' | 9069-9093 |  |  |
S6 | P6S | 5'--- AGGAGTCAAGGAAGTGCTCAACG---3' | 8787-8809 | 2178 | 58 |
 | P6R | 5'--- AGATCCTGTGTTCTTCCTCACCACC ---3' | 10940-10964 |  |  |