Table 4 Overview of strains used for phylogenetic analysis
Strain | Genotype | Genbank Accession ORF5 | Genbank Accession ORF1a (nsp2) |
|---|---|---|---|
VR-2332 | 2 | U87392 | U87392 |
Lelystad | 1 (subtype 1) | M96262 | M96262 |
EuroPRRS | 1 | AY366525 | AY366525 |
01-CB1 | 1 (subtype 1) | DQ864705 | DQ864705 |
Amervac | 1 (subtype 1) | GU067771 | GU067771 |
HKEU16 | 1 (subtype 1) | EU076704 | EU076704 |
KNU-07 | 1 (subtype 1) | FJ349261 | FJ349261 |
SHE | 1 (subtype 1) | GQ461593 | GQ461593 |
SD01-08 | 1 (subtype 1) | DQ489311 | DQ489311 |
BJEU06-1 | 1 (subtype 1) | GU047344 | GU047344 |
NMEU09-1 | 1 (subtype 1) | GU047345 | GU047345 |
07V063 | 1 (subtype 1) | GU737264 | GU737264 |
PyrsVac | 1 (subtype 1) | DQ324681 | ND |
Porcilis | 1 (subtype 1) | AAW78901 | ND |
Olot/91 | 1 (subtype 1) | X92942 | ND |
Yuz-34 | 1 (subtype 3) | DQ324692 | ND |
Bel-42 | 1 (subtype 3) | DQ324669 | ND |
Obu-1 | 1 (subtype 3) | DQ324671 | ND |
Soz-6 | 1 (subtype 3) | DQ324686 | ND |
Dzi-62 | 1 (subtype 1) | DQ324675 | ND |
Cresa11 | 1 (subtype 1) | DQ009626 | ND |
IV3140 | 1 (subtype 1) | DQ355821 | ND |
28639/98 | 1 (subtype 1) | AY035912 | ND |
361-4 | 1 (subtype 1) | AY035915 | ND |
Sno-4 | 2 (subtype 2) | DQ324683 | ND |
Sid | 2 (subtype 2) | DQ324682 | ND |
Aus | 2 (subtype 2) | DQ324667 | ND |
Okt-35 | 1 | DQ324677 | ND |
16/2000 | 1 | DQ345743 | ND |
SD02-11 | 1 (subtype 1) | AY395078 | AY383634 |
SD01-07 | 1 (subtype 1) | AY395079 | AY383632 |
SD03-12 | 1 (subtype 1) | AY395074 | AY383635 |
SD03-15 | 1 (subtype 1) | AY395076 | AY383636 |
It-22 | 1 (subtype 1) | AY739978 | ND |
It-39 | 1 (subtype 1) | AY739995 | ND |
It-44 | 1 (subtype 1) | AY740000 | ND |
It-35 | 1 (subtype 1) | AY739991 | ND |
It-13 | 1 (subtype 1) | AY739969 | ND |
Lena | 1 (subtype 3) | EU909691 | ND |