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Table 3 Amino acid residue substitution of F gene for NDV strains of different genotypes.

From: Molecular characterization of partial fusion gene and C-terminus extension length of haemagglutinin-neuraminidase gene of recently isolated Newcastle disease virus isolates in Malaysia

Isolate/genotype/Subgenotype 52 71 78 79 82 101 104 107 108 114 115 117 121 124
Consensus I K K A E R G S T Q K F I S
MB061/06 II . . . . D . E T . . G L . G
MB043/06 VII . . R . . K . . M R . . . .
MB016/07 VII V R . . . K . . . . . . V .
MB064/05 VII V R . . . K . . . . . . V .
MB076/05 VII . . . . . . . . . . . . V .
MB047/05 VII . . . . . K . A . . . . V .
MB091/05 VII . . R . . K . . . R . . . .
MB093/05 VII . . R . . K . . . R . . . .
MB095/05 VII . . R . . K . . . R . . . .
MB128/04 VII . . R . . K . . . R . . . .
MB085/05 VIII . . . T . . . T . . . . . .
AF2240 VIII . . . P . . . T . . . . V .
QH-1/79 VIII . . R T . . . T . . . . V .
QH-4/85 VIII . . R T . . . T . . . . V .
V4 Queensland I . . . . . . E T . . G L . G
Ulster/67 I . . . . . . E T . . G L . G
LaSota II . . . . D . E T . . G L . G
Miyadera III . . . . . . E T . . R . . .
Herts/33 IV . . . . . . E T . . R . . .
Italien IV . . . . . . E T . . R    
CA1085/71 V . . . . . . . T . . . . . .
H-10/72 V . . . . . . . T . . . . . .
Iraq AG68 VIa . . . . . . . . . . . . . .
Lebanon -70 VIa . . . . . . . . . . . . . .
TX3503/04 VIb . . . . . . . . . K . . . .
NDV05-027VIb . . . . . . . . . . . . . .
Q-GB 506/97VIc . R . .   . . . . . . . . .
DK-1/95VId . . . . . . . . . . . . . .
DE 143/95VIIa . . . . . K . . . . . . V .
Cockatoo/14698/90VIIa . . . . . K . . . . . . V .
ZA360/95VIIb . . . . . . . . . . . . V .
ZW 3422/95VIIb . . . . . . . . . . . . V .
NDV05-055 VIIc . . . . . K . . . . . . V .
Ch/2000VIId V R . . . K . . . . . . V .
TW/2000 VIId V . . . . K . . . . . . V .
TW/95-1VIIe . . . T . K . . . . . . V .
ZhJ-1/85 IX . . . . . . E T . . . . . .
FJ-1/85 IX . . . . . . E T . . . . . .