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Table 3 Amino acid residue substitution of F gene for NDV strains of different genotypes.

From: Molecular characterization of partial fusion gene and C-terminus extension length of haemagglutinin-neuraminidase gene of recently isolated Newcastle disease virus isolates in Malaysia

Isolate/genotype/Subgenotype

52

71

78

79

82

101

104

107

108

114

115

117

121

124

Consensus

I

K

K

A

E

R

G

S

T

Q

K

F

I

S

MB061/06 II

.

.

.

.

D

.

E

T

.

.

G

L

.

G

MB043/06 VII

.

.

R

.

.

K

.

.

M

R

.

.

.

.

MB016/07 VII

V

R

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

MB064/05 VII

V

R

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

MB076/05 VII

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

V

.

MB047/05 VII

.

.

.

.

.

K

.

A

.

.

.

.

V

.

MB091/05 VII

.

.

R

.

.

K

.

.

.

R

.

.

.

.

MB093/05 VII

.

.

R

.

.

K

.

.

.

R

.

.

.

.

MB095/05 VII

.

.

R

.

.

K

.

.

.

R

.

.

.

.

MB128/04 VII

.

.

R

.

.

K

.

.

.

R

.

.

.

.

MB085/05 VIII

.

.

.

T

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

AF2240 VIII

.

.

.

P

.

.

.

T

.

.

.

.

V

.

QH-1/79 VIII

.

.

R

T

.

.

.

T

.

.

.

.

V

.

QH-4/85 VIII

.

.

R

T

.

.

.

T

.

.

.

.

V

.

V4 Queensland I

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

G

L

.

G

Ulster/67 I

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

G

L

.

G

LaSota II

.

.

.

.

D

.

E

T

.

.

G

L

.

G

Miyadera III

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

R

.

.

.

Herts/33 IV

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

R

.

.

.

Italien IV

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

R

   

CA1085/71 V

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

H-10/72 V

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

Iraq AG68 VIa

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Lebanon -70 VIa

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

TX3503/04 VIb

.

.

.

.

.

.

.

.

.

K

.

.

.

.

NDV05-027VIb

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Q-GB 506/97VIc

.

R

.

.

 

.

.

.

.

.

.

.

.

.

DK-1/95VId

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

DE 143/95VIIa

.

.

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

Cockatoo/14698/90VIIa

.

.

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

ZA360/95VIIb

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

V

.

ZW 3422/95VIIb

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

V

.

NDV05-055 VIIc

.

.

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

Ch/2000VIId

V

R

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

TW/2000 VIId

V

.

.

.

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

TW/95-1VIIe

.

.

.

T

.

K

.

.

.

.

.

.

V

.

ZhJ-1/85 IX

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

.

.

.

.

FJ-1/85 IX

.

.

.

.

.

.

E

T

.

.

.

.

.

.