Isolate/genotype/subgenotype

11

12

13

14

16

17

18

19

20

22

25

26

28

29

30

36


Consensus

V

P

L

M

I

T

R

I

M

I

C

I

L

T

S

P


MB061/06II

A

.

M

.

T

I

.

V

A

V

.

.

P

A

N

.

MB043/06VII

T

.

P

.

.

.

.

.

.

.

F

.

.

A

.

.

MB016/07 VII

A

.

.

.

.

I

.

.

.

.

Y

V

.

.

.

.

MB064/05VII

A

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

MB076/05VII

.

.

.

I

T

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

S

MB047/05VII

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

MB091/05 VII

T

S

P

.

.

.

Q

.

.

.

F

.

.

A

.

.

MB093/05 VII

T

S

P

.

.

.

Q

.

.

.

F

.

.

A

.

.

MB095/05 VII

T

S

P

.

.

.

Q

.

.

.

F

.

.

A

.

.

MB128/04 VII

T

S

P

.

.

.

Q

.

.

.

F

.

.

A

.

.

MB085/05 VIII

T

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

.

AF2240 VIII

T

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

P

.

.

.

QH1/79 VIII

T

.

S

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

G

.

QH4/85VIII

T

.

S

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

G

.

V4 Queensland I

.

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.

.

T

V

.

V

.

A

.

V

P

.

.

.

Ulster/67 I

.

.

.

.

T

V

.

V

A

E

.

V

P

.

.

.

LaSota II

A

.

M

T

T

I

.

V

A

V

.

.

P

A

N

.

Miyadera III

A

.

.

.

T

I

W

.

A

A

.

V

.

.

.

.

Herts/33 IV

A

.

P

.

.

I

.

.

V

T

.

.

.

.

.

.

Italien IV

.

.

.

.

.

I

.

.

A

T

.

.

.

.

.

.

CA1085/71 V

.

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

.

H10/72 V

.

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

.

Iraq AG68 VI

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Lebanon 70 VI

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

TX3503/04 VI

A

.

.

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.

.

.

.

NDV05027VI

A

.

.

.

.

.

.

.

T

V

.

.

.

.

.

.

QGB 506/97VI

P

.

.

.

.

.

.

.

V

.

S

V

.

.

.

.

DK1/95VI

.

.

P

.

.

.

.

.

T

.

.

.

.
 
.

.

DE 143/95VII

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

Cockatoo/14698/90VII

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

S

.

.

.

ZA360/95VII

.

.

.

.

.

.

.

V

.

.

.

.

.

.

G

.

ZW 3422/95VII

.

.

.

.

.

.

.

V

.

.

.

.

.

.

G

.

NDV05055 VII

A

.

.

I

.

.

.

.

.
 
.

.

.

A

.

.

Ch/2000VII

A

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

P

.

.

.

TW/2000 VII

A

.

.

T

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

TW/951VII

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

.

ZhJ1/85

A

.

.

.

T

A

.

.

A

A

.

V

.

.

N

.

FJ1/85

A

.

.

.

T

V

.

.

A

A

.

V

.

.

N

.

 Genetic identity with consensus sequence is marked by dot (.).The bolded residues were residues discussed in the text.