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Table 1 Relative gene expression in ASK cells 3 days p.i. normalized to 2 housekeeping genes (EF1α and 18S)

From: Analysis of host- and strain-dependent cell death responses during infectious salmon anemia virus infection in vitro

  ISAV 2 ISAV4 ISAV 7 ISAV 10
Gene Mean ± SD Mean ± SD Mean ± SD Mean ± SD
Ifn-α 27,0a 7,6 175,1b 54,9 78,8c 25,3 53,7c 16,3
Mx-1 39,0a 5,8 105,1b 13,3 82,0b 14,3 52,5a 8,7
Isg-15 702,4* 135,0 1720,0* 311,6 1315,5* 303,6 1068,5* 217,5
p62 5,7* 0,8 3,2* 0,5 8,5* 1,7 6,7* 1,0
Galectin-9 14,2a 1,9 21,9b 3,1 20,0b 3,3 20,8b 3,2
Ciap-1 2,4ac 0,5 2,5ab 0,5 3,4b 0,8 2,1c 0,4
Caspase-3a 1,2* 0,1 1,1 0,1 1,2* 0,2 1,1 0,2
p53 0,5a 0,1 0,7b 0,1 0,4a 0,1 0,5a 0,1
Hsp-70 41,8a 5,0 26,9a 4,3 56,0b 11,2 71,2b 9,3
Hsp-90 1,0 0,1 0,8* 0,1 0,9* 0,1 1,0 0,1
Transaldolase-1 0,2a 0,0 0,4b 0,1 0,2a 0,0 0,2a 0,0
Tnf-α 16,4* 9,6 27,2* 16,3 47,3* 27,5 27,8* 15,8
Il-1β 8,3* 5,9 3,7 2,8 11,9* 9,2 9,7* 6,9
Bcl-2 1,1 0,2 0,9 0,2 1,2 0,3 1,0 0,2
Mcl-1 1,1 0,1 1,4* 0,2 1,6* 0,3 1,4* 0,2
Ogf-1 4,5a 0,6 6,9b 0,9 6,8b 1,2 4,8a 0,7
Pdcd-5 1,1 0,1 0,7* 0,1 1,0 0,2 1,0 0,1
Fip-2 1,8* 0,4 2,0* 0,4 2,4* 0,5 1,9* 0,3
Cox-2 7,5* 3,3 3,9* 1,9 10,9* 5,3 9,5* 4,3
Nfκ-β 1,8* 0,2 2,0* 0,3 3,0* 0,5 2,0* 0,3
Rig-1 3,9* 1,4 5,5* 1,7 5,7* 1,9 4,5* 1,4
  1. *Genes that were significantly different from mock are marked with an asterisk.
  2. a, b, cGenes that were both different from mock and varied with isolate are marked with letters.