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Table 2 Amino Acid mutation of HBc sequence deviated from HBV core gene.

From: The role of mutations in core protein of hepatitis B virus in liver fibrosis

 

T helper epitopes

CTL epitopes

B cell epitopes

C-terminal

subject

T12

S35

Y38

E64

M66

E113

I116

M93

T147

R151

E77

A80

P130

P135

S176

S181

1

-

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-

-

-

-

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-

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-

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-

2

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D

I

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-

P

3

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-

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-

-

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-

4

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F

-

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-

-

Q

-

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-

5

S

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-

V

A

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6

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-

T

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-

7

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-

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-

8

-

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-

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-

V

-

-

-

V

-

-

-

-

9

-

-

-

D

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

P

10

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

11

-

-

-

-

-

-

-

T

-

-

-

V

-

-

-

-

12

-

T

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

13

-

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-

-

-

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-

-

-

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-

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-

14

-

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-

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-

15

-

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16

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-

Q

-

-

-

17

-

-

-

D

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

18

-

-

-

-

-

-

-

-

-

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-

-

-

-

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-

19

-

-

F

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

P

20

-

-

-

-

-

-

L

-

-

-

-

-

-

-

-

-

21

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

22

-

-

-

D

-

-

-

-

-

-

-

-

-

Q

-

-

23

S

-

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-

I

-

-

-

-

-

-

-

Q

-

-

-

24

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

-

25

-

-

F

-

-

-

-

-

-

R

-

-

-

-

-

P

26

-

-

-

-

-

Q

-

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-

-

-

-

-

-

27

-

-

-

-

-

-

-

T

-

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-

V

-

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-

28

-

T

-

D

-

-

-

-

-

-

-

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-

-

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-

29

-

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-

-

-

-

-

-

C

-

-

-

-

-

-

-

Frequency (%)

2(6.9)

2(6.9)

3(10.3)

5(17.2)

2(6.9)

1(3.4)

1(3.4)

3(10.3)

1(3.4)

1(3.4)

1(3.4)

4(13.8)

2(6.9)

2(6.9)

1(3.4)

4(13.8)

  1. The consensus sequence of genotype D is shown in the first line. Dashes represent residues identical to the reference residues.