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Table 2 Percent (%) nucleotide identity of Ark DPI structural genes with other IBV strains a, b, c, d

From: Complete genomic sequence analysis of infectious bronchitis virus Ark DPI strain and its evolution by recombination

BV Strains S1 S2 3a 3b 3c M 5a 5b N 3'UTR
Ark99 97(96) 96(95) 92 99 96(92) 97(97) 93 97 98(98) 97
Beaudette 81(79) 95(94) 91 84 88(83) 91(93) 85 93 93(95) 97
BJ 77(75) 85(89) 88 76 87(79) 90(93) NA NA 89(93) 87
Cal99* 87(84) 94(93) 92 99 94(90) 97(96) 100 98 95(98) 89
CK/CH/LSD/05I 78(75) 88(91) 89 84 (87) 96(96) 99 100 100(99) 90
Conn 81(77) 96(96) 92 99 100(100) 100(100) 100 100 100(100) NA
CU-T2* 96(94) 93(93) 88 98 92(87) 88(87) 97 99 95(96) 97
DE072 62(50) 75(76) NA NA NA NA 98 98 NA 98
Gray 83(80) 99(99) NA NA 96(92) 98(98) 97 99 97(97) 98
GAV-92 94(92) NA NA NA NA NA NA NA NA NA
H120 81(78) NA NA NA NA 92(94) NA NA 93(96) 83
HK* 81(78) 96(96) 99 100 100(100) 100(100) 100 100 100(100) NA
Holte 83(80) 95(95) NA NA NA NA NA NA NA NA
Ind/TN/92/03 NA NA NA NA NA NA NA NA 92(94) NA
IS/1366 78(75) NA NA NA NA NA NA NA 92(95) NA
Jilin* 100(99) 100(100) 100 100 100(100) 100(100) 100 100 100(100) 100
JMK 84(82) 100(100) NA NA NA 97(98) NA NA NA NA
KB8523 81(78) 91(92) NA NA NA 93(95) NA NA 95(96) NA
LX4 77(76) 85(88) 86 76 88(80) 91(91) 82 90 89(93) NA
M41 81(78) 95(94) 91 85 88(83) 91(95) 90 97 94(95) 97
Qu16 84(81) NA NA NA NA NA NA NA NA NA
SAIBK 79(77) 87(91) 86 83 85(80) 89(93) 84 96 87(92) 88
TW2296/95 79(77) 86(90) 86 85 (83) 91(92) 82 96 89(92) NA
UK/2/91 78(76) NA NA NA NA NA NA NA NA NA
Vic 81(79) 89(92) 88 88 88(88) 89(95) 87 94 90(94) NA
  1. a Sequences with > 95% identity are indicated in bold letters
  2. b Amino acid sequences within the parenthesis
  3. c NA-Not Analyzed
  4. d Parental strains of Ark DPI are shown in bold letters and immediate derivative of Ark DPI is indicated by asterisk (*).