Skip to main content

Table 2 Re-annotation of the Megalocytivirus genus

From: Comparative genomic analysis of the family Iridoviridae: re-annotating and defining the core set of iridovirus genes

ISKNVa Start Stopc aad RBIVa Start Stopc aad OSGIVa Start Stopc aad
1L 1270 134 378 1L 1270 134 378 1L 1270 134 378
2R 1394 2044 216 2R b 1394 1597/1781 67 2R 1394 1789 131
- - - - 3R 1841 2056 71 3R 1849 2064 71
3L 2634 2077 185 4L 2605 2102 167 4L 2613 2110 167
4L 2890 2681 69 5L 2800 2624 58 5L 2808 2632 58
5L 3648 2893 251 6L 3541 2876 221 6L 3548 2883 221
6L 5155 3794 453 7L 5147 3786 453 7L 5154 3793 453
7L 6631 5174 485 8L 6621 5164 485 8L 6628 5171 485
8R 6669 8246 525 9R 6692 8239 515 9R 6699 8246 515
9R 8342 8503 53 10R 8335 8496 53 10R 8342 8503 53
10L 9054 8662 130 11L 9047 8655 130 11L/12L b 9055 8849/8662 130
11L 9311 9051 86 11.5L 9304 9044 86 13L 9312 9052 86
12R 9330 9659 110 12R 9323 9655 110 14R 9331 9663 110
13R 9669 11054 461 13R 9662 11059 465 15R 9670 11067 465
14R 11309 12268 319 14R 11314 12288 324 16R 11322 12296 324
15R 12278 13069 263 15R 12298 13089 263 17R 12302 13093 263
16L 13716 13129 195 16L 13733 13146 195 18L 13738 13151 195
17L 14095 13718 125 17L 14086 13748 112 19L 14088 13753 111
17.5R 14089 14325 78 18R 14171 14410 79 20R 14094 14351 85
18.5L b 14563 14233 109 19L 14648 14472 58 21L 14607 14431 58
19R 14579 17425 948 20R 14664 17510 948 22R 14623 17469 948
20L 17642 17454 62 21L 17756 17574 60 23L 17715 17533 60
21L 17900 17778 40 21.5L 18014 17892 40 24L 17973 17851 40
22L 19489 17990 499 22L 19714 18104 536 25L 19715 18063 550
23R 19562 22132 856 23R 19787 22204 805 26R 19788 22922 1044
24R 22300 23238 312 26R 23035 23973 312 27R 23207 24145 312
25R 23354 23779 141 27R 23997 24380 127 28R 24169 24696 175
26L 24145 23822 107 27.5L 24697 24377 106 29L 25013 24693 106
27L 25063 24167 298 28L 25615 24719 298 30L 25931 25035 298
28L 28559 25080 1159 29L 29138 25632 1168 31L 29454 25948 1168
29L 28814 28593 73 29.5L b 29362 29087/29145 91 32L 29682 29461 73
31.5L 29414 28884 176 30.5L 29957 29430 175 33.5L 30277 29750 175
32R 29447 30061 204 31R 29990 30622 210 34R 30310 30942 210
33L 31079 30138 313 32L 31654 30713 313 35L 31935 31033 300
34R 31144 34278 1044 33R 31700 34861 1053 36R 32018 35176 1052
35L 35508 34360 382 34L 36067 34934 377 37L 36382 35249 377
36R 35546 36601 351 35.5R 36061 37113 350 38R 36376 37431 351
37L 37950 36598 450 37L 38219 37110 369 39L 38777 37428 449
38L 39395 37959 478 38L 39974 38469 501 40L 40225 38786 479
39R 39439 40311 290 39.5R b 40012 40506/40857 164 41R 40290 41168 292
40L 41443 40304 379 41L 41995 40850 381 42L 42306 41161 381
41L 42788 41445 447 42L 43346 41997 449 43L 43657 42308 449
42R 42803 43396 197 43R 43361 43959 198 44R 43672 44271 199
43L 43842 43480 120 43.5L 44405 43975 142 45L 44717 44355 120
44L 44645 43845 266 44L 45208 44408 266 46L 45524 44724 266
45L 45564 44650 304 45L 46127 45213 304 47L 46443 45529 304
46L 46241 45558 227 46L 46804 46121 227 48L 47120 46437 227
47R 46401 46664 87 47R 47150 46887 87 49R 47280 47543 87
48R 46661 47005 114 47.5R b 47224 47433/47588 69 50R 47540 47893 117
49R 47021 47191 56 48.5R 47604 47774 56 51R 47909 48079 56
50L 47678 47250 142 49L 48270 47842 142 52L 48575 48147 142
51R 47733 47864 43 - - - - - - - -
52L 48403 47951 150 50L 48999 48547 150 53L 49306 48854 150
53R 48405 48620 71 51R 49001 49195 64 54R 49308 49502 64
54L 49559 48633 308 52L 50173 49229 314 55L 50480 49536 314
55L 50508 49582 308 53L 51137 50196 313 56L 51444 50503 313
56L 51166 50519 215 54L 51795 51148 215 57L 52102 51455 215
57L 51433 51173 86 55L 52062 51802 86 58L 52369 52109 86
59L 52414 51749 221 56L 52839 52327 170 59L 53146 52634 170
61L 53162 52359 267 57L 53709 52903 268 60L 54016 53210 268
62L 56785 53159 1208 58L 57467 53706 1253 61L/62L b 55131 54013/53893 372
63L 59875 57227 882 59L 60567 57919 882 63L 60876 58228 882
64L 61393 59918 491 60L b 62102 60855/60635 415 64L 62416 60944 490
65L 61900 61439 153 61L 62611 62144 155 65L 62928 62458 156
66L 63025 61982 347 62L 63744 62662 360 66L 64061 62979 360
67L 63855 63271 194 63.5L 64446 63865 193 67.5L 64763 64182 193
68L 65329 63896 477 64L 65917 64484 477 69L 66234 64801 477
69L 66001 65336 221 65L b 66661 66215/65929 148 70L 66977 66246 243
70L 66331 66101 76 - - - - - - - -
71L 68042 66432 536 68L 68529 67120 469 71L 68973 67417 518
72R 68173 69177 334 - - - - - - - -
73R 69203 69622 139 69R b 68717 69191/69135 157 72R 69078 69497 139
74R 69669 70682 337 70R 69184 70203 339 73R 69546 70568 340
75L 71043 70777 88 71L 70573 70304 89 74L 70938 70669 89
76L 74017 71045 990 72L 73541 70575 988 75L 73912 70940 990
77R 74035 75369 444 73R 73559 74893 444 76R 73930 75264 444
78R 75366 75830 154 75R 74890 75354 154 77R 75261 75725 154
79L 76053 75832 73 76L 75580 75356 74 78L 75951 75727 74
- - - - 77R 75664 76137 157 79R 76039 76512 157
80L 76368 76165 67 - - - - - - - -
81R 76367 76864 165 78R 76150 76647 165 80R 76525 77022 165
82L 78007 76901 368 79L 77802 76696 368 81L 78177 77071 368
83R 78152 78418 88 80R 77827 78225 132 82R 78202 78600 132
84L 79881 78526 451 81L 79556 78252 434 83L 79931 78627 434
85R 79884 80486 200 82R 79643 80173 176 84R 80018 80548 176
86R 80483 80947 154 82.5R 80170 80637 155 84.5L 80545 81012 155
87R 80940 81710 256 83R 80603 81400 265 85R 80978 81775 265
88R 81717 83720 667 84R 81503 83425 640 86R/87R b 82234 83805/82279 523
90.5L 84663 83701 320 85L 84457 83630 275 88.5L 84811 83786 341
93L 85786 84860 308 86L 85504 84578 308 90L 85918 84992 308
94L 86296 85796 166 87L 86014 85514 166 91L 86428 85928 166
95L 87481 86321 386 88L 87202 86039 387 92L 87616 86453 387
96L 88298 87489 269 89.5L b 87601 87218/87210 127 93L 88361 87624 245
97.5L 88723 88232 163 90L 88443 87952 163 94L 88857 88366 163
99L 89097 88774 107 91L 88814 88491 107 95L 89229 88906 107
100L 89689 89144 181 92L 89515 88868 215 96L 90024 89377 215
101L 90251 89736 171 93.5L 89999 89470 175 97L 90508 89993 171
102R 90311 91753 480 94R 90068 91513 481 98R 90577 92022 481
103R 91760 92161 133 95.5R 91477 91935 152 99R 92029 92442 137
104R 92215 92991 258 96R 91994 92773 259 100R 92501 93280 259
105R 92993 93358 121 97R 92775 93146 123 101R 93282 93653 123
- - - - 98R 93240 94127 295 102R 93747 94634 295
106L 94501 93482 339 99L 95042 94221 273 103L 95548 94676 290
108.5L 95093 94494 199 100.5L 95699 95068 209 104.5L 96217 95574 213
109L 97950 95185 921 101L 98557 95792 921 106L 99060 96298 920
110R 97997 98152 51 101.5L 98609 98764 51 107R 99113 99268 51
111L 99039 98149 296 102L 99657 98761 298 108L b 99885 99265/99849 206
112R 99059 99802 247 103R b 99677 100426/100422 249 109R 100183 100926 247
113R 99937 100290 117 104.5R 100493 100909 138 110R 100998 101414 138
114L 103159 100334 941 106L b 103615 102539/100953 358 111L 104041 101594 815
115R 103203 104213 336 108.5R 104050 104781 243 112R 104476 105486 336
116R 104219 105667 482 110R 105060 106493 477 113R 105547 106701 384
117L 106395 105721 224 111L 107221 106547 224 114L 107652 106978 224
118L 108093 106723 456 112L 108913 107549 454 115L 109299 107986 437
119R 108105 108392 95 113R 108931 109104 57 116R 109369 109656 95
120R 108424 108933 169 114R 109248 109637 129 117R 109687 110193 168
121L 109584 108934 216 115L 110419 109756 220 118L 110849 110214 211
122R 109594 110313 239 116R 110429 111148 239 119R 110859 111578 239
123R 110391 110576 61 117R 111226 111420 64 120R 111656 111850 64
124L 111351 110665 228 118L 112037 111576 153 121L 112625 111939 228
  1. aORFs that have been added or altered are highlighted in bold. If a previously annotated ORF is not listed in the table, it has been deleted.
  2. bPotentially frameshifted ORF
  3. cWhere an ORF has a potential sequencing error resulting in a frameshift mutation, 2 stop codons are provided in the format X/Y. The first number represents the actual physical stop in the reported sequence. The second number is the proposed stop if a sequencing error occurred.
  4. dLength of ORF in amino acids